真空烘箱是利用高温使微生物细胞内的蛋白质凝固变性而达到灭菌的目的。细胞内的蛋白质变性与其本身含水量有关，在菌体受热时，环境和细胞内含水金越大，蛋自质凝固就越快，反之含水见越少，凝固就越缓慢。因此，与高压蒸汽灭菌相比，干操箱灭菌所需温度更高(160~170℃)，时间更长((1-2h)。温度不能超过180℃，否则，包装器皿的纸或棉塞就会烧热，甚至引起燃烧。
真空烘箱的温度计的温度是吸收了热辐射而产生的温度。而这种热辐射被吸收的量，与温度计材质表面的粗糙程度及材质对红外线辐射的吸收、折射和透射能力等因数有密切联系。而这时温度计的读数也仅仅只能代表温度计自身吸收红外线辐射热后的温度，而不能代表其它不同材质不同表面状态工件所吸收热辐射后的实际温度。
用户在初次使用真空烘箱时，建议先做一个应用试验，即记录下所需加热物体的表面状态、物体的数量、安放位置、仪表和温度计的读数。待烘干结束再检查烘干的效果，从中决定z佳的物品数量和仪表(或温度计)的读数。这样做，可以收到事半功倍的效果。
真空烘箱整体运输进行安装的，由于运输过程中各部件有移位现象，使用时必须对部件进行调正，以保证烘箱的使用效果。一种高密闭性的箱体，除非出厂便是不合格的产品。万一漏气如何处理呢？
1、检查烘箱门上密封，门上密封是否老化，看颜色和弹性，如果老化，可以联系厂家更换，视镜的密封圈也不能被忽略，它有可能也是密封不好，漏气的起因，还是一样，该更换的必须更换。
2、将所有的阀门依次检查是否有漏气现象，检查方法是将箱体抽真空，当真空度达到一定程度，可用手在关闭的球阀端口堵住出口，如果手有被吸入的感觉可立即更换球阀，表明这个球阀是漏气的，这个需要一个一个的试。
